mVAEN

名称 mVAEN
类别 健康与疾病检测
开发者 贾佩林
描述 mVAEN是一种基于基线表达数据预测药物反应的深度生成方法。它利用带有掩码层的​​变分自动编码器(VAE),并将转录组数据压缩为低维空间中的潜在向量。新引入的掩模层结合了先前的基因通路映射,因此,它提供了可解释的基因嵌入。由此产生的基因基础随后用于训练用于药物反应预测的弹性网络(EN)模型。由于 mVAEN 可以使用基线基因表达谱进行训练,因此它可以应用于广泛的临床环境。
下载地址 https://bioinfo.uth.edu/drvaen/
文章发布 https://academic.oup.com/bib/article-abstract/24/3/bbad098/7085476

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