CNCB - Tool Info

名称	单细胞Hi-C层次化拓扑相关结构域识别软件(deDoc2)
类别	单细胞与空间组学
版本号	v1.0
开发者	李昂生，曾广杰，王浩宇，李笑，张治华
描述	deDoc2是一种利用结构信息论的类染色体拓扑相关结构域（TAD-like domain, TLD）预测工具，它将Hi-C接触图视为一个加权图，并应用动态规划算法对图分区的二维结构熵进行全局优化。deDoc2 由两个预测器组成，deDoc2.w 和 deDoc2.s，分别预测更高级别、更大和更低级别、更小的 TLD。deDoc2.w 最小化整个 Hi-C 接触图中的结构熵，而 deDoc2.s 最小化滑动窗口矩阵中的结构熵。deDoc2.w和deDoc2.s的识别结果组合可形成层次化的TLD结构。
下载地址	https://github.com/zengguangjie/deDoc2
文章发布	https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/advs.202300366
引用次数	1
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