CNCB - Tool Info

名称	三维基因组可视化和分析平台(Delta)
类别	基因组组装与注释
开发者	唐碧霞，李飞飞，李敬，赵文明，张治华
描述	Delta是一个集成的可视化和分析平台，有助于直观地注释和探索基因组的3D物理结构。Delta以Hi-C或ChIA-PET的相互作用矩阵作为输入，并预测基因组中的拓扑关联结构域和染色质的相互作用。Delta提供了基因组一致性的3D模型结构。Delta具有高度交互式可视化特性，通过在一个界面中并排显示3D模型和芯片数据，增强了基因组的拓扑或物理结构以及基因组注释信息的数据整合。最后，通过可视化的比较β-球珠蛋白的基因位点和其上的注释信息，我们提出了该位点的一个可能的相互作用模式，并通过文献调研找到了支持该假设的实验证据。作为Delta可用于帮助假设验证的例子。
在线网址	https://delta.ngdc.cncb.ac.cn/
文章发布	https://academic.oup.com/bioinformatics/article/34/8/1409/4747883?login=true
引用次数	11
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