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| 名称 | 泛基因组分析流程工具(PGAP) |
|---|---|
| 类别 | 基因组组装与注释 |
| 版本号 | V1.2.1 |
| 开发者 | 赵永兵，吴佳妍，杨俊辉，孙世翔，肖景发，于军 |
| 描述 | 功能基因的聚类：根据序列相似性，将所有细菌中的功能基因按功能聚类成不同的基因簇；泛基因组特征分析：拟合细菌的泛基因组特征曲线以及分析泛基因组开放、闭合特征；功能基因的遗传变异分析：分析所有功能基因中突变、插入删除位点；物种演化分析：基于核心基因中的SNP位点信息和基因簇的有无，分析细菌的演化关系；基因簇的功能富集分析：根据COG分类，分析不同保守程度基因簇的功能富集特征。 |
| 下载地址 | https://ngdc.cncb.ac.cn/biocode/tools/BT000007 |
| 文章发布 | https://academic.oup.com/bioinformatics/article/30/9/1297/237096?login=true |
| 引用次数 | 132 |
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