CloudPhylo

名称 CloudPhylo
类别 系统发生与分子进化
开发者 徐行健,章张
描述 CloudPhylo是一个基于Spark构建的工具,能够处理大规模数据集进行系统发育树构建。经过实证数据验证, CloudPhylo主要采用CVTree的无序列比对方法统计模型,除了CloudPhylo的Spark版本(CloudPhylo-Spark)外,还实现了一个Hadoop版本(CloudPhylo-Hadoop),以评估它们在实际数据上的性能表现。CloudPhylo非常适合于大数据分析,在系统发育树推断方面具有高效性和良好的可扩展性。
下载地址 https://ngdc.cncb.ac.cn/biocode/tools/BT000006
文章发布 https://academic.oup.com/bioinformatics/article/33/3/438/2585051?login=false
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