基于病毒序列的分类学分配(VISTA)

名称 基于病毒序列的分类学分配(VISTA)
类别 系统发生与分子进化
开发者 鲍一明, 张韬
描述 VISTA,一种新型的基于成对序列比较系统的病毒分类工具。它不仅适用于过去难以分类的病毒科,还集成了自动阈值筛选系统,可快速高效地为每一条病毒基因组序列给予最合适的分类学分配。VISTA可以生成成对距离的频数分布,利用分布中不同峰之间的谷点位置来决定各级分类的界限阈值。与大部分基于比对的病毒分类方法不同,VISTA采用与机器学习技术相结合的非比对方法来提高其性能,并将其应用范围成功地扩大到更了多的病毒上,是一个通用性更强的分类工具。
下载地址 https://hub.docker.com/r/taozhangbig/vista
在线网址 https://ngdc.cncb.ac.cn/vista/index

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