基于外周血基因表达强度的方法(rankDetect)

名称 基于外周血基因表达强度的方法(rankDetect)
类别 健康与疾病检测
版本号 v1.0
开发者 杨亚东,肖茹丹,张韬,方向东
描述 基于外周血基因表达强度的方法用于区分健康个体和癌症患者的能力受到了批次效应、数据归一化和表达谱分析方法之间的变异性的限制。为了提高基于血液基因表达的肿瘤检测的鲁棒性和精确性,有必要采用更稳定的方法进行分子诊断测试。以乳腺癌为例,我们提出了一个基于机器学习的框架,通过对每个样本中基因表达强度进行成对的排序转换,从而区分乳腺癌患者和健康个体。这种基于排名的自学习模型可以提供有价值的乳腺癌诊断信息,并且对批次效应和数据归一化不敏感。
下载地址 https://ngdc.cncb.ac.cn/biocode/tools/BT007224
文章发布 https://doi.org/10.1093/bib/bbz027
引用次数 8
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