名称 | C-GWAS |
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类别 | 健康与疾病检测 |
开发者 | 熊子义,刘凡,高行健 |
描述 | C-GWAS是一种强大的方法,可以将多个潜在相关性状的GWAS摘要统计量相结合,检测具有多性状效应的SNP。对于每个SNP, null表示对所有性状都没有任何影响,反之,其影响至少对一个性状偏离0。C-GWAS集成了两种具有互补统计特征的不同统计方法,以确保在各种复杂场景下的最优功耗,同时保持稳定的全研究范围内的type-I错误率。第一种方法称为基于迭代效应的逆协方差加权(iterative effect based inverse covariance weighting, i-EbICoW),第二种方法称为截断Wald检验(truncated Wald test, TWT)。c -GWAS通过模拟以经验方式控制研究范围内的i型错误率,并调整得到的p值,使其与单一性状的传统GWAS的p值直接可比. |
下载地址 | https://ngdc.cncb.ac.cn/biocode/tools/7350 |
文章发布 | https://www.nature.com/articles/s41467-022-35328-9 |
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