基因组溯源(GenomeTracing)

名称 基因组溯源(GenomeTracing)
类别 系统发生与分子进化
版本号 v1.0.22
开发者 马文泰,史雷胜,李明锟
描述 GenomeTracing是一种新型的基因组追踪算法,可以在一分钟内处理数百万条SARS-CoV-2序列。该方法不依赖于构建巨大的系统发育树,而是利用自主开发的一个基于突变特征的加权评分系统以量化序列之间的相似度。与其它基于系统发育树和非加权序列相似性搜索的方法相比,该方法显示出优越的性能。基于此方法的在线平台可以实现基因组追踪和序列的时空分布的可视化。该方法能够更有效地进行基因组追踪,可以成为常规流行病学调查的的辅助手段。
下载地址 https://github.com/ipplol/GenomeTracing
在线网址 https://ngdc.cncb.ac.cn/ncov/online/tool/genome-tracing/

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