CNCB - Tool Info

名称	基于最小树形图的单体型网络构建工具(McAN)
类别	系统发生与分子进化
版本号	V1.4.1
开发者	李论，许博，王安可，朱军伟，宋述慧
描述	McAN是基于最小树形图的单体型网络构建工具。McAN解决了传统单体型网络构建算法运行速度慢、内存消耗大等问题，能对海量新冠序列进行演化追踪分析。对约1000条新冠病毒全基因组小数据集的测试表明，McAN的运行速度比传统方法提升了两个数量级；对约500万条新冠病毒序列大数据集测试，McAN算法耗时约25分钟（50线程），具有处理海量病原基因组序列的能力；在模拟数据集上的测试表明，不损失精度的同时McAN的内存消耗与传统方法相比降低90%以上；在猴痘、甲型流感等多种数据集上，McAN均得到合理的结果。
下载地址	https://ngdc.cncb.ac.cn/biocode/tools/BT007301
在线网址	https://ngdc.cncb.ac.cn/bit/hapnet/
文章发布	https://doi.org/10.1093/bib/bbad174
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