CNCB - Tool Info

名称	泛基因组特征分析工具(PanGP)
类别	基因组组装与注释
开发者	赵永兵，贾鑫淼，杨俊辉，凌鋆超，章张，于军，吴佳妍，肖景发
描述	我们开发了一种名为PanGP的工具，可以有效地完成大规模菌株的泛基因组特征分析。PanGP集成了两种采样算法，完全随机（TR）和距离引导（DG）。DG算法根据细菌种群的基因组多样性绘制样本菌株组合。在菌株数从30到200不等的4个细菌群体上评估了这两种算法的性能，DG算法在准确性和稳定性方面表现出压倒性的优势。
下载地址	https://ngdc.cncb.ac.cn/biocode/tools/BT000007
文章发布	https://academic.oup.com/bioinformatics/article/30/9/1297/237096?login=true
引用次数	132

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