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| 名称 | LGC |
|---|---|
| 类别 | 基因组组装与注释 |
| 开发者 | 王光煜，马利娜，章张 |
| 描述 | LGC用于在跨物种的情况下准确区分长链非编码RNA（lncRNA）和编码蛋白质的RNA(mRNA)，无需任何先验知识。通过大规模实证数据验证，比较结果显示LGC算法在准确性上胜过现有算法，具有良好的敏感性和特异性平衡，并且在从植物到哺乳动物等各种物种中，能够以鲁棒性地（>90%准确率）区分lncRNA和mRNA。据我们所知，本研究首次基于特征关系对lncRNA和mRNA进行不同特性的表征，并进一步应用于计算机辅助识别lncRNA，LGC算法因此具有广泛的潜在应用价值，可用于各种物种中lncRNA的计算分析。 |
| 下载地址 | https://ngdc.cncb.ac.cn/biocode/tools/BT000004 |
| 在线网址 | https://ngdc.cncb.ac.cn/lgc/ |
| 文章发布 | https://academic.oup.com/bioinformatics/article/35/17/2949/5288512?login=false |
| 引用次数 | 60 |
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