单细胞胶囊网络(scCapsNet)

名称 单细胞胶囊网络(scCapsNet)
类别 单细胞与空间组学
开发者 王力飞,聂瑞,于泽阳,辛茹月,郑彩宏,章张,张江,蔡军
描述 单细胞胶囊网络(single cell Capsule Network, scCapsNet)是一个决策过程可解释的基于胶囊网络的分类器,用于单细胞转录组分析。单细胞胶囊网络能通过模型的内部参数找出细胞类型相关基因。通过细胞类型相关基因,单细胞胶囊网络能将基因与细胞类型直接联系起来,提高了深度学习模型的可解释性。本质上,单细胞胶囊网络将基因的表达特征和细胞类型特征进行低维编码,这样的编码富含生物学意义。
下载地址 https://ngdc.cncb.ac.cn/biocode/tools/BT007156
文章发布 https://www.nature.com/articles/s42256-020-00244-4
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