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| 名称 | DEMIC |
|---|---|
| 类别 | 基因组组装与注释 |
| 版本号 | v1.0.2 |
| 开发者 | Yuan Gao, Hongzhe Li |
| 描述 | DEMIC是一种基于contig覆盖度的多样本算法。它可以用来推断contig与复制原点的相对距离，并由此比较样品间的细菌生长速度。使用DEMIC的准备工作包括：1）通过MegaHit和Spades等组装算法对不同样品中的宏基因组读数进行共同组装；2）通过BowTie2将宏基因组读段与生成的contig进行映射，由samtools排序；3）通过MaxBin和MetaBAT将等位基因组聚类分箱。 |
| 下载地址 | https://sourceforge.net/projects/demic/ |
| 文章发布 | https://www.nature.com/articles/s41592-018-0182-0 |
| 引用次数 | 39 |
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